A Quinta Guerra do Santo Graal continua e o caos resultante resulta em maiores riscos para todos os participantes. Shirou Emiya continua a participar da guerra, aspirando a ser um herói da justiça que salva todos. Ele parte em busca da verdade por trás de uma misteriosa sombra escura e sua onda de assassinatos, determinada a derrotá-la.