Embora tenha apenas dezesseis anos e parecer ainda mais jovem, Misao Makimachi já é uma habilidosa e competente membro do clã ninja Oniwabanshu. Isso é uma sorte para Misao, porque seus talentos onimitsu podem ser tudo o que a mantém viva quando uma jornada em busca do líder do clã, Aoshi Shinomori, leva ela a um encontro cara-a-cara com um homem ainda mais perigoso e uma conspiração para derrubar o governo Meiji!