Situado em 2050, Kong torna-se um fugitivo procurado depois de ter destruído a história natural e a Reserva Marinha da Ilha de Alcatraz. O que a maioria dos seres humanos na caçada ao formidável animal não percebe, porém, é que Kong foi enquadrado por um gênio maligno que planeja aterrorizar o mundo com um exército de enormes dinossauros robóticos. Como a única besta suficientemente forte para salvar a humanidade dos dinos mecânicos, Kong deve contar com a ajuda de três crianças que conhecem a verdade sobre ele.